Hlavním orgánem je valná hromada, která se schází jednou za rok. Není společná, ale zvláštní pro každou národní část.
Předsednictvo i předseda jsou voleni na čtyřleté období tak, aby bylo zhruba respektováno volební období do obecních zastupitelstev. Sedmnáctičlenné předsednictvo tvoří vždy starostové Českého Krumlova, Prachatic, Klatov a Domažlic a zástupci menších obcí z okresů Český Krumlov, Prachatice, Klatovy, Domažlice a Strakonice a Regionálního sdružení Šumava. Hejtmani z Plzeňského a Jihočeského kraje jsou členy s hlasem poradním. Národní předsednictva se schází při slavnostních příležitostech přibližně jednou za dva roky.
Orgány sdružení:
Valná hromada
Předsednictvo
Warning: include(../deconn.inc): failed to open stream: No such file or directory in /var/www/html/euregion/spolecne/prispevek_tisk.php on line 16 Warning: include(): Failed opening '../deconn.inc' for inclusion (include_path='.:/var/www/php') in /var/www/html/euregion/spolecne/prispevek_tisk.php on line 16